В состав ИПАР входят не только сами аудиторские организации, но и Территориальные Институты Профессиональных Аудиторов (филиалы ИПАР). Организационная структура ИПАР, утвержденная членами-учредителями, позволяет Институту при небольшом аппарате проводить масштабную работу по различным вопросам, входящим в компетенцию созданных комитетов и комиссий.
Институт принимает участие в мероприятиях, направленных на помощь членам ИПАР в организации работ по обязательному аудиту государственных унитарных предприятий, в работе по проекту Закона «Об аудиторской деятельности», в разработке процедур саморегулирования, включая программы распространения стандартов и контроль качества аудиторских услуг.
В июне 2000 года компания АКГ «Прайм Эдвайс» выступила одним из учредителей ИПАР.